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高光譜應(yīng)用案例
使用無人機高光譜圖像和小型校準數(shù)據(jù)集對田間土壤有機質(zhì)進行高分辨率測繪
中國農(nóng)業(yè)發(fā)生于新石器時代。中國農(nóng)業(yè)的生產(chǎn)結(jié)構(gòu)包括種植業(yè)、林業(yè)、畜牧業(yè)、漁業(yè)和副業(yè);但數(shù)千年來一直以種植業(yè)為主。東北地區(qū)的黑土地,是寶貴的農(nóng)業(yè)資源。黑土地的土壤富含有機質(zhì),深黑色的沃土,沉甸甸的感覺讓人感受到這片土地的肥沃。在現(xiàn)代農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中,科技的應(yīng)用在這片沃土上也發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,科研團隊利用機載高光譜對黑土地的土壤有機質(zhì)做了相關(guān)研究。使用無人機高光譜圖像和小型校準數(shù)據(jù)集對田間土壤有機質(zhì)進行高分辨率測繪快速獲取田間尺度土壤有機質(zhì)(SOM)的高分辨率空間分布對于精準農(nóng)業(yè)至關(guān)重要。無人機成像高光譜技術(shù)以其高空間分辨率和時效性,可以填補地面監(jiān)測和遙感的研究空白。本研究旨在測試在中國東北典型低地勢黑土地區(qū)使用無人機高光譜數(shù)據(jù)(400–1000 nm)和小型校準樣本集進行1 m分辨率SOM繪圖的可行性。該實驗在大約20公頃的土地上進行。為了進行校準,使用 100 × 100 m 網(wǎng)格采樣策略收集了 20 個樣品,同時隨機收集了 20 個樣品進行獨立驗證。無人機捕獲空間分辨率為0.05×0.05 m的高光譜圖像。然后對每 1 × 1 m 內(nèi)提取的光譜進行平均以代表該網(wǎng)格的光譜。在應(yīng)用各種光譜預(yù)處理(包括吸光度轉(zhuǎn)換、多重散射校正、Savitzky-Golay 平滑濾波和一階微分)后,SOM 光譜相關(guān)系數(shù)的絕對最大值從 0.41 增加到 0.58。最佳隨機森林(RF)模型的重要性分析表明,SOM 的特征波段位于 450-600 和 750-900 nm 區(qū)域。當使用RF模型時,無人機高光譜數(shù)據(jù)(UAV-RF)能夠成功預(yù)測SOM,R 為0.53,RMSE為1.48 g kg?1。然后將預(yù)測精度與使用相同數(shù)量校準樣本的普通克里金法(OK)和基于近端傳感的射頻模型(PS-RF)獲得的預(yù)測精度進行比較。然而,由于采樣密度較低,OK 方法無法預(yù)測 SOM 精度(RM...
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2024
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使用無人機高光譜圖像和小型校準數(shù)據(jù)集對田間土壤有機質(zhì)進行高分辨率測繪
中國農(nóng)業(yè)發(fā)生于新石器時代。中國農(nóng)業(yè)的生產(chǎn)結(jié)構(gòu)包括種植業(yè)、林業(yè)、畜牧業(yè)、漁業(yè)和副業(yè);但數(shù)千年來一直以種植業(yè)為主。東北地區(qū)的黑土地,是寶貴的農(nóng)業(yè)資源。黑土地的土壤富含有機質(zhì),深黑色的沃土,沉甸甸的感覺讓人感受到這片土地的肥沃。在現(xiàn)代農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中,科技的應(yīng)用在這片沃土上也發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,科研團隊利用機載高光譜對黑土地的土壤有機質(zhì)做了相關(guān)研究。使用無人機高光譜圖像和小型校準數(shù)據(jù)集對田間土壤有機質(zhì)進行高分辨率測繪快速獲取田間尺度土壤有機質(zhì)(SOM)的高分辨率空間分布對于精準農(nóng)業(yè)至關(guān)重要。無人機成像高光譜技術(shù)以其高空間分辨率和時效性,可以填補地面監(jiān)測和遙感的研究空白。本研究旨在測試在中國東北典型低地勢黑土地區(qū)使用無人機高光譜數(shù)據(jù)(400–1000 nm)和小型校準樣本集進行1 m分辨率SOM繪圖的可行性。該實驗在大約20公頃的土地上進行。為了進行校準,使用 100 × 100 m 網(wǎng)格采樣策略收集了 20 個樣品,同時隨機收集了 20 個樣品進行獨立驗證。無人機捕獲空間分辨率為0.05×0.05 m的高光譜圖像。然后對每 1 × 1 m 內(nèi)提取的光譜進行平均以代表該網(wǎng)格的光譜。在應(yīng)用各種光譜預(yù)處理(包括吸光度轉(zhuǎn)換、多重散射校正、Savitzky-Golay 平滑濾波和一階微分)后,SOM 光譜相關(guān)系數(shù)的絕對最大值從 0.41 增加到 0.58。最佳隨機森林(R...
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IRIS機載一體式激光雷達高光譜成像儀在評估雜草抗性方面的應(yīng)用
“倘若有什么植物妨礙了我們的計劃,或是擾亂了我們干凈整齊的世界,人們就會給它們冠上雜草之名??扇绻惚緵]什么宏偉大計或長遠藍圖,它們就只是清新簡單的綠影,一點也不面目可憎?!?#160; ——《雜草的故事》清新簡單的綠影自然面目可愛,惹人注目,但人類生存之下,繁多冗雜的一片蔓延,確是明目張膽地搶了農(nóng)作物的地盤,傷了農(nóng)業(yè)發(fā)展。世界上的雜草有1000多種,它們通常生長迅速、繁殖能力強,會對農(nóng)業(yè)產(chǎn)生一定的影響。雜草不僅會與農(nóng)作物爭奪土壤養(yǎng)分和水分,傳播病蟲害,從而影響農(nóng)作物的生長和產(chǎn)量,含有毒素的雜草還會影響農(nóng)作物品質(zhì)。因此,對于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)來說,防治雜草對保證農(nóng)作物的正常生長和產(chǎn)量至關(guān)重要。IRIS機載一體式激光雷達高光譜成像儀在評估雜草抗性方面的應(yīng)用雜草防治是現(xiàn)代農(nóng)業(yè)生產(chǎn)管理的重要組成部分。然而,過度依賴常用除草劑進行化學(xué)防治已導(dǎo)致大量抗性雜草的出現(xiàn),對可持續(xù)農(nóng)業(yè)構(gòu)成重大威脅。因此,開發(fā)一種大面積準確評估和量化田間雜草抗性的方法對于農(nóng)場管理和可持續(xù)發(fā)展至關(guān)重要。目前的方法,例如目視檢查,既費時又費力。酶測定雖然準確,但只能在實驗室環(huán)境中進行。熱成像技術(shù)可能會受到環(huán)境因素的影響,導(dǎo)致在室外使用時精度較低。因此,無法大規(guī)模應(yīng)用。無人機(UAV)和各種傳感器已經(jīng)成為植物表型研究中不可或缺的工具。在這項研究中,作者于2021年6月7日在中國黑龍江省哈爾濱市向陽農(nóng)場(位于...
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2023
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Resonon | 高光譜成像結(jié)合機器學(xué)習(xí)檢測火炬松幼苗梭形銹病發(fā)病率
高光譜成像結(jié)合機器學(xué)習(xí)檢測火炬松幼苗梭形銹病發(fā)病率火炬松是美國南部最重要的森林樹種,它生長迅速、適應(yīng)性強,可用于建筑木材、膠合板和紙漿等。松梭形銹病是由真菌Cronartium quercuum f.sp. fusiforme(Cqf)引起的一種影響該物種的常見且具有破壞性的病害。這種真菌通常會感染幼樹的莖,導(dǎo)致被稱為“銹癭”的腫瘤樣生長物產(chǎn)生,可能會造成樹木死亡或產(chǎn)生“銹叢”,從而妨礙樹木生長,降低木材使用價值。種植抗病苗是限制該病害的最有效的措施。溫室中抗病性測試在人工接種幼苗后的目視估計病害發(fā)病率和嚴重程度具有高度主觀性,容易出現(xiàn)人為錯誤,且勞動密集。此外,目視評估只有在病害感染一段時間后,癥狀充分發(fā)展時才能進行。而高光譜成像可同時獲取空間和光譜信息,提供了在不同空間尺度上分析光譜信息的機會,已成功應(yīng)用于多種植物物種的病害和脅迫檢測?;诖?,在本文中,來自北卡羅來納州立大學(xué)和密西西比州立大學(xué)的研究團隊提出了一種利用高光譜成像技術(shù)篩選火炬松幼苗梭形銹病發(fā)病率的創(chuàng)新方法,具體目標為(1)開發(fā)高光譜圖像處理管道,用于從火炬松幼苗圖像中的特定感興趣區(qū)域(ROI)中提取光譜數(shù)據(jù);(2)基于來自(1)的特定ROI的光譜數(shù)據(jù),評估用于區(qū)分患病和未患病幼苗的SVM分類模型。圖1 火炬松幼苗高光譜圖像采集的成像裝置?!靖吖庾V圖像獲取】線性掃描高光譜成像儀(Pika XC2,Resonon In...
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2022
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Resonon | PIKA NIR高光譜成像在估算積雪密度上的應(yīng)用
改進積雪密度的估計是目前雪研究的一個關(guān)鍵問題。表征密度時空變異性對于水當量的估算、水力發(fā)電和自然災(zāi)害(雪崩洪水等)的評估至關(guān)重要。高光譜成像是一種監(jiān)測和估計其物理特性的有前途且可靠的工具。事實上,雪的光譜反射率在一定程度上受其物理特性變化的控制,尤其是在光譜的近紅外(NIR)部分。為此,已經(jīng)設(shè)計了幾種模型根據(jù)光譜信息估算積雪密度。然而,還沒有一個實現(xiàn)滿意的結(jié)果。主要困難之一是積雪密度和光譜反射率之間的關(guān)系是非雙射的(滿射的)。事實上,幾個反射振幅與相同的密度相關(guān),反之亦然,所以密度和光譜反射率之間的相關(guān)性可能非常弱?;诖?,為了解決該問題,本研究中提出了基于光譜數(shù)據(jù)的積雪密度估計混合模型。主要研究目標是利用高光譜NIR成像(PIKA NIR,RESONON Company)(900-1700 nm)以5.5 nm的光譜分辨率測試混合模型(HM)估計季節(jié)性積雪密度的性能?;旌夏P徒Y(jié)合了一個分類器和3個與密度類別相關(guān)聯(lián)的特定估算量(弱到中度變質(zhì)雪(WMM),中度到高度變質(zhì)雪(MHM)和高度到極高度變質(zhì)雪(HVM))。利用2018(1.19-3.27)、2019(1.10-4.3)和2020(1.29-3.10)年冬季在加拿大魁北克國立科學(xué)研究院(INRS)的科技園內(nèi)(46°47′43.22″北緯,-71°18′10″西經(jīng))收集的數(shù)據(jù)集校準和驗證了HM?;旌夏P驮趦蓚€...
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2022
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利用近端高光譜成像快速篩選光合參數(shù)
全球氣候變化引起的預(yù)計人口增長以及土地和農(nóng)業(yè)資源可利用性的壓力使未來幾十年全球糧食供應(yīng)的需求增加。提高光合作用能力已成為實現(xiàn)作物增產(chǎn)的目標。目前,測量光合作用的方法是耗時的且具破壞性的,這會減慢鑒定具高光合能力的農(nóng)作物種質(zhì)的研究和育種工作。作者在1分鐘內(nèi)收集樣地(~2 m×2 m)向陽葉片像素的高光譜反射率以量化光合作用參數(shù)和色素含量。在兩個生長季節(jié)(2017年和2018年)利用田間生長的經(jīng)基因改變了光合途徑的煙草,建立了8個光合參數(shù)和色素性狀的預(yù)測模型。利用偏最小二乘法(PLSR)分析可見近紅外(400-900 nm)光譜相機測得的植物反射像素,預(yù)測了Rubisco最大羧化速率(Vc,max,R2=0.79)和最大電子傳遞速率(J1800,R2=0.59),最大光飽和光合作用(Pmax,R2=0.54),葉綠素含量(R2=0.87),葉綠素a/b(R2=0.63),碳含量(R2=0.47)和氮含量(R2=0.49)。當使用兩臺400-1800 nm相機時,模型的預(yù)測并沒有改善,這表明僅使用一臺VNIR相機就能實現(xiàn)強大,廣泛適用且更具“成本效益”的效果。該分析過程和方法可用于所有作物中,從而提供高通量田間表型篩選,并在田間試驗中提高光合性能。高光譜圖像收集建立基于地面的表型平臺(圖1),包括兩個推掃式高光譜相機。第一臺高光譜相機(P...
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2021
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利用高光譜成像診斷作物冷害
冷害是造成作物嚴重損失和不可逆轉(zhuǎn)傷害的災(zāi)害之一。為避免產(chǎn)量損失,可利用高通量表型選擇耐寒脅迫的作物品種。如今,無損光譜圖像分析已成為一種有效方法,并已廣泛應(yīng)用于高通量表型分析中,反映出植物結(jié)構(gòu)組成,生長發(fā)育過程中的生理,生化特性和特征。本研究利用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)模型提取可見-近紅外范圍的特征光譜估計玉米幼苗的冷害。文中以五個品種的冷處理玉米幼苗的高光譜圖像為研究對象。光譜范圍為450-885 nm。高斯低通濾波和Savitzky-Golay平滑方法結(jié)合一階導(dǎo)數(shù)進行光譜數(shù)據(jù)的預(yù)處理。從每種玉米幼苗選定的感興趣區(qū)域獲取3600個像素樣本用于CNN建模。CNN模型建立后,從高光譜圖像中提取400個像素樣本作為每個品種的測試集。最后,通過分析分類準確度和計算效率確定一個CNN模型。CNN檢測到的不同類型的玉米幼苗的冷害水平分別為W22 (41.8 %),BxM (35%), B73 (25.6%),PH207 (20%), Mo17 (14%),與化學(xué)方法的結(jié)果高度相關(guān)。兩種方法檢測結(jié)果的相關(guān)系數(shù)為0.8219。因此,研究證明基于CNN建模的光譜分析可以為玉米幼苗冷害監(jiān)測提供參考。高光譜成像采集利用推掃式高光譜相機(PIKA II,Resonon)成像系統(tǒng)的整個結(jié)構(gòu)感興趣區(qū)域樣本數(shù)據(jù)選擇程序樣本的3D光譜分布CNN和化學(xué)方法結(jié)果的比較結(jié)論自卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)發(fā)...
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2020
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高光譜成像在無脊椎動物上的應(yīng)用
近端成像遙感技術(shù)可根據(jù)特定的外部反射特征對生物體進行表征和特征描述。這些成像技術(shù)引起了人們的關(guān)注,并廣泛應(yīng)用于植物和動物的生態(tài)、系統(tǒng)、進化以及生理研究中。然而,重要的因子可能會影響質(zhì)量和體反射率特征的一致性,從而影響這些技術(shù)作為非侵入式表型和特征的部分能力。我們從3種昆蟲中獲得了高光譜體反射率,并研究了制備程序和保存時間如何影響反射率對性別,來源和年齡響應(yīng)的能力。輻射光譜的不同部分對制備程序和保存時間的敏感性差異很大?;?個昆蟲物種的研究,我們成功確定了特定的輻射區(qū)域,基于以下兩個方面,表型形狀變得更加明顯:(1)用蒸餾水輕輕清洗博物館標本,或(2)用70%的乙醇殺死并保存昆蟲標本。殺死和保存程序的標準化將極大地提高近端成像遙感技術(shù)在表征和研究無脊椎動物生態(tài)和進化上的能力?!静牧稀?3個葉蟬標本(41個雌性和42個雄性)(半翅目:葉蟬科),來源于西北農(nóng)林科技大學(xué)昆蟲博物館。獲取所有標本清潔前后的高光譜圖像。新捕獲的實驗室飼養(yǎng)的西花薊馬標本,最初是2007從中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所溫室中甜瓜上采集的。新捕獲的褐飛虱標本(半翅目:飛虱科)來自浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院稻田的實驗室飼養(yǎng)群體。【光譜成像】在標本上方20厘米安裝推掃式高光譜相機(PIKA XC,Resonon),并在人工照明下以50 px/mm2的空間分辨率采集光譜圖像。蒸餾水清洗前后葉蟬雄性和雌性代表圖像(a)。在波長435-...
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利用近端遙感區(qū)分非病毒性和病毒性昆蟲媒介—數(shù)據(jù)抗干擾性的證明及重要性
近端遙感作為昆蟲病媒中植物病原檢測的診斷工具,有兩個基本假設(shè)。首先,通過昆蟲媒介獲得植物病原體會引起昆蟲媒介的生理變化;也就是說,病原體可能只存在于非常特殊的組織或器官(如唾液腺),但它可能引起昆蟲媒介對病原體的系統(tǒng)生理變化/反應(yīng)。其次,根據(jù)體表反射特征,即使在殺死昆蟲標本,并將其儲存在70%的乙醇中以后,也能檢測到病原體對昆蟲生理學(xué)的影響。最近對后一種假設(shè)進行了調(diào)查,并證明建議將樣本儲存在70%乙醇(與50%或90%相比)中。這項研究表明,在70%乙醇中儲存長達數(shù)周的時間對昆蟲樣品反射特性的影響微乎其微。這些技術(shù)細節(jié)非常重要,因為它們強調(diào)了昆蟲標本可以在現(xiàn)場收集、儲存在70%乙醇中,并可以在進行診斷成像測試之前裝運,但是在開始廣泛試驗之前,應(yīng)評估每種昆蟲的這種效果是否可行。越來越多的學(xué)者開始研究利用近端遙感技術(shù)來檢測和診斷植物和昆蟲病媒中的病原體,這說明這種基于反射的技術(shù)可用于改進檢疫和檢驗工作以及區(qū)域作物疾病監(jiān)測。也就是說,與商業(yè)診斷實驗室目前提供的基于PCR和酶聯(lián)免疫吸附試驗的服務(wù)類似,反射的技術(shù)似乎也擁有提供此類服務(wù)的潛力,以便農(nóng)業(yè)利益相關(guān)者能夠?qū)⒗ハx樣本運送到這些實驗室,并獲得關(guān)于感染率的快速、可靠和經(jīng)濟有效的數(shù)據(jù)。遙感數(shù)據(jù)是在與先前研究類似的環(huán)境條件下從單個成年甜菜葉蟬樣本中獲取的。成體樣本的年齡、性別和交配狀態(tài)未知,目的是模擬成體甜菜葉蟬在田間采樣時遇到的變異。使用安...
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基于高分辨率無人機的高光譜圖像小麥的LAI和葉綠素估算
高效的N肥使用產(chǎn)出需要平衡最小的環(huán)境污染和最大的產(chǎn)量,N素使用效率是目前精準農(nóng)業(yè)中重要問題之一。于2017年6月,應(yīng)用無人機高光譜成像系統(tǒng)對八種不同氮處理的冬小麥進行了高光譜圖像采集。高光譜成像儀采用美國RESONON公司的Pika-L,波段范圍400-1000nm,系統(tǒng)集成了慣導(dǎo)測量系統(tǒng)(IMU)和穩(wěn)定云臺,可以獲得較高精度的光譜分辨率和空間分辨率的數(shù)據(jù)。同時在地面采集并獲得冬小麥的葉綠素含量(CHL)、葉面積(LAI),利用偏最小二乘法進行反演估算,(RLAI 2= 0.79, RMSELAI [m2m2] = 0.18, R2CHL = 0.77, RMSECHL [_g cm-2] = 7.02),并采用多元線性回歸模型進行了產(chǎn)量估測(R2產(chǎn)量=0.88,RMSEfield[dt ha-1]=4.18)。利用該模型,可以對高光譜圖像進行像素水平的預(yù)測。結(jié)果表明,在一定施氮量以上,進一步施肥不一定會繼續(xù)導(dǎo)致產(chǎn)量增加,為高光譜精準農(nóng)業(yè)研究提供了一定了理論支持。1 實驗設(shè)計試驗田位于德國西北部的奧斯納布呂克大學(xué),包括8個處理,6個施氮水平。氮肥水平選擇在0到150 kg ha-1,如圖所示,不同顏色代表了不同的處理。圖1研究區(qū)域2 數(shù)據(jù)處理高光譜傳感器采用美國RESONON公司的PikaL,無人機系統(tǒng)采用大疆無...
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利用高光譜成像預(yù)測柑橘品質(zhì)屬性
【背景】:高光譜成像技術(shù)可以快速且無損的測量食物品質(zhì)。該研究調(diào)查了高光譜成像在400-1000 nm波段范圍預(yù)測柑橘果實內(nèi)部品質(zhì)屬性例如總可溶性固形物(TSS),pH,可滴定酸度(TA)和成熟度指數(shù)(TSS/TA);以及外部品質(zhì)屬性,例如顏色成分(L*,a*, b*)和顏色指數(shù)(CI)的可行性。【方法】:從亞馬遜州(秘魯)收集柑橘樣品(甜橙,瓦倫西亞品種),共80個無不良特征(如物理破壞,病害以及污染成分)的樣品。樣品隨機分為兩組,75%為“校正集”,其余為“預(yù)測集”,用于模型的外部驗證。利用Resonon Pika XC高光譜成像系統(tǒng)(400-1000 nm)掃描柑橘并采集圖像。利用偏最小二乘法建立預(yù)測品質(zhì)屬性的完整模型。利用回歸系數(shù)確定最優(yōu)波段,通過多元線性回歸建立簡化模型。預(yù)測的確定系數(shù)(R2p)以及預(yù)測的標準誤差(SEP)用來衡量模型的性能。【結(jié)果】:內(nèi)部品質(zhì)屬性的完整模型性能較低(R2p ,SEP 50%)。外部品質(zhì)屬性的完整模型性能較高(L*:R2p = 0.898,SEP = 19%;a*:R2p = 0.952,SEP = 13%;b*:R2p = 0.922,SEP = 20%;CI:R2p = 0.972,SEP = 12%)。簡化模型與外部品質(zhì)屬性性能相似。柑橘圖像和光譜處理的主要步驟:(a)確認感興趣區(qū)域;(b)原始平均反射光譜...
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